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#カガク#生体分子#分子#医薬#感染。抗インフルエンザ薬アビガン(Avigan)は商品名で,一般名はファビピラビル(favipiravir,T-705;インフルエンザウイルスのRNAポリメラーゼ阻害剤)。JmolトピックNo.620 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.twitter.com/4wt8nuRehG

新薬情報オンライン | パスメド -PASS MED-@shinyaku_online

アビガン錠(ファビピラビル)の効能・効果に「重症熱性血小板減少症候群(SFTS)ウイルス感染症」を追加することが承認了承されていました! 世界初・国内初のSFTSウイルス治療薬です!😊 インフルエンザ治療薬として承認されたものの日の目を見ないままでしたが、ついに…!

本間善夫 - 科学コミュニケーター@ecochem

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#カガク#分子#医薬。日経メディカル「人気の持効性オピオイド、トラマドール錠がオキシコドン徐放錠を抜いて、首位浮上」の(1R,2R)-トラマドール((1R,2R)-tramadol)。JmolトピックNo.832 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.twitter.com/cSmqhWhSiV

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#カガク#生体分子#分子#医薬#感染。鍵と鍵穴。グラデーション。NHK「マダニ媒介感染症 SFTS治療薬に「アビガン」正式承認の見通し」の抗インフルエンザ薬アビガン(Avigan)は商品名で,一般名はファビピラビル(favipiravir,T-705)。JmolトピックNo.620に追記。 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.twitter.com/Hmtm2LDMR0

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#カガク#植物#生体分子#分子。鍵と鍵穴。グラデーション。理研「植物の発根を促進する新規機能性アミノ酸を同定」(YouTube動画あり)のL-2-アミノピメリン酸(L-2-aminopimelic acid)と参考データの同分子結合PDBデータ例5E3RとそのPDBsumデータ。JmolトピックNo.1230 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.twitter.com/votwvragkh

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#カガク#生体分子#分子#医薬。GPCR。理研「アロステリック調節薬が構造平衡を変えて効く仕組み」のYouTube動画公開。GPCR関連ニュースに掲載。 ecosci.jp/GPCR/news.html 未公開PDBデータ8K9L・8K9K。 pic.twitter.com/Ep6FTw8ApJ

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#カガク#分子#嗅覚#新刊。朝倉書店「皮膚ガスのはなし」へのリンクをJmol悪臭のページに追加。図は2-ノネナール(加齢臭)とアリシン(ニンニク臭)。ecosci.jp/env2/smell.html pic.twitter.com/f3okhM3Tk3

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#カガク##生体分子#分子。GPCR。鍵と鍵穴。グラデーション。本日公開のPDB 8JPN(他に8JPP公開)のR鎖とそのPDBsumデータ,アゴニストのcis-エポキシコハク酸が結合したコハク酸受容体1(SUCR1)。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ 8JPNってJPNが入ってる。 pic.twitter.com/vRbpTlH7RQ

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#カガク#生体分子#分子。鍵と鍵穴。グラデーション。本日公開のPDBデータ244件の中から8XCM(他に8K6J・8K6K・8XCN公開)のA鎖とPDBsumデータ,FADと鉄硫黄クラスターが結合したフルクトースデヒドロゲナーゼ。京都大学の研究。JmolトピックNo.641に追記。 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.twitter.com/MVlsSjFKjI

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#カガク#生体分子#聴覚#AI。クラスC GPCR。GPR156。LigPlot+による“鍵と鍵穴”。グラデーション。先ほどのScience Portal KoreaプレスリリースよりPDB 8IEI(cif→pdb変換)のA鎖とそのPDBsumデータ,リン脂質のligand A1LYAが結合したGPR156。緑優勢。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ pic.twitter.com/IgF8rWDUh5

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#カガク#生体分子#分子#AI。AlphaFold2!。GPCR。5-HT2AR。鍵と鍵穴。グラデーション。話題のScience論文関連情報をAlphaFold構造ページにも追記。 ecosci.jp/AF/#AF2_240516 pic.twitter.com/BZE5LXAFNZ

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#カガク#生体分子#分子#AI。AlphaFold2!。GPCR。5-HT2AR。鍵と鍵穴。グラデーション。話題のScience論文(未公開PDBデータ8V6U・8UWL,他に7RAN・7WC7・6A93・6A94引用)関連情報をGPCR関連ニュースにまとめる。 ecosci.jp/GPCR/news.html… pic.twitter.com/UGqZ5W6ndW

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#カガク##感染#分子#医薬#生体分子。ニュース多数の溶連菌・人食いバクテリア関連研究。治療薬候補のMn007(Mannan-007)と参考PDBデータ2XH3(DNase)のA鎖。JmolトピックNo.1229 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.twitter.com/jOj1Uicus6

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#カガク#音楽#マンガ#新刊。“元素・分子が登場する本を読もう!” 講談社ブルーバックス「生命と非生命のあいだ 地球で「奇跡」は起きたのか」読了。コラムも興味深く。コラム3『天体の音楽』に「惑星」や「木星」、コラム4では一コマ漫画ネタでサイト紹介。 thefarside.com/comic-collecti… pic.twitter.com/gjPGPFD6v7

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#カガク#分子#。コルヒチン(colchicine)。Jmolトピック「毒」展 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.twitter.com/FpYFBWreHt

Masakazu Sekijima@m_sekijima

北海道の事故でイヌサフランの毒性成分調べたらコルヒチンで、構造見ると薬としてもありそうと思ったら、実際、痛風治療薬でCYP3A4で代謝されるようだ(創薬ちゃんが、前に呟いていて流石)。 副作用が出るまでには数時間かかるらしく、誤食に早く気がつければ対応可能なこともあるようだ。

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#カガク#生命誕生#分子#生体分子#宇宙#地球#新刊。“元素・分子が登場する本を読もう!” 講談社ブルーバックス「生命と非生命のあいだ 地球で「奇跡」は起きたのか」掲載分子等の紹介開始。JmolトピックNo.1228 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.twitter.com/dSSRmraRL1

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#カガク#医薬#分子#生体分子#新刊。“元素・分子が登場する本を読もう!” 化学同人「奇跡の薬16の物語」のChem-Station記事が出ました!! 化合物作業中のJmolトピックNo.1244に追記し,少し分子も追加。p.8には“「オクタノール/水」分配係数”(緑枠)も出ています。 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.twitter.com/NbMVKApdwP

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#カガク#生体分子#分子。GPCR。鍵と鍵穴。グラデーション。既報PDBデータのCell Research誌の論文が一昨日出ました。画像はPDB 8XOF(他に8XOG・8XOH・8XOI・8XOJ公開)のR鎖とそのPDBsumデータ,阻害剤Lys01が結合したGPR30。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ pic.twitter.com/YWMBxWg1lz

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#カガク#生体分子#分子。膜タンパク質。鍵と鍵穴。グラデーション。昨日公開のPDB 9B8Z(他に9B8W・9B8X・9B8Y・9B90・9B91・9B92・9B93・9B94公開)のPDBsumデータ,デカバナジン酸(decavanadate)が結合したTRPM4チャネル。JmolトピックNo.779に追記。 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.twitter.com/mHSKaen7iy

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#カガク#生体分子#分子#医薬。鍵と鍵穴。グラデーション。本日公開のPDB 8WGU(他に8WGS・8WGT公開)のA鎖とそのPDBsumデータ,compound 20が結合したトランスサイレチン。緑・ピンク拮抗。JmolトピックNo.819に追記。 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.twitter.com/VeUzPS9gPe

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#カガク#生体分子#分子。GPCR。鍵と鍵穴。グラデーション。本日公開のPDBデータ354件の中から8FYE(他に8FY8・8FYL・8FYT・8FYX公開)のR鎖とそのPDBsumデータ,4-F,5-MeO-PyrTが結合したセロトニン受容体5-HT1AR。緑優勢。Jmol GPCR ecosci.jp/GPCR/ pic.twitter.com/Yv8aVmKEGq

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#カガク#宇宙#星屑#分子。メタントリオール(methanetriol)。 ecosci.jp/s/bm_all_j.htm… pic.twitter.com/eCvEcdl4QD

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#カガク#生体分子#AI。AlphaFold3/"AlphaFold 3"にチャレンジ2件目のタンパク質+DNAの計算例,AlphaFold3の使い方(PDB 1GT0を例に)や参考ページをecosci.jpに載せました。 ecosci.jp/pdb/iPS_1gt0.h… pic.twitter.com/aiTyfaE0zN

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#カガク#生体分子#AI。AlphaFold3/"AlphaFold 3"にチャレンジ2件目,タンパク質+DNAの計算結果画像修正。データ入力時にミスがあったか不要データあったので削除してスッキリ。明日分子構造参照可能にします。 pic.twitter.com/ailXGKpeXf

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#カガク#生体分子#AI。AlphaFold3/"AlphaFold 3"にチャレンジ2件目,タンパク質+DNAです。3Dプリンタ模型作成済みのPDB 1GT0で。1枚目画像上段は配列入力画面,下段は計算結果です。画像2枚目はPDB 1GT0の既報例。 pic.twitter.com/C4RnBiB22R

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#カガク#生体分子#AI。AlphaFold3/"AlphaFold 3"初試用データをWebページにアップ。PDB 3HCDのA鎖とAlphaFold 3構造(構造参照可能に)とのPyMOLによる重ね合わせ。リガンド含む構造取得可能のAlphaFill構造(昨年3Dプリンタ模型作製)との比較を画像で。 ecosci.jp/AF/#P11086 pic.twitter.com/9ZOPxrdmzf

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#カガク#生体分子#AI。AlphaFold3/"AlphaFold 3"初試用続き。PDB 3HCDのA鎖とAlphaFold 3構造とのPyMOLによる重ね合わせ。 今日はこれからアメフト観戦ほかで以後は明日。DNA入りにもチャレンジ。 pic.twitter.com/4dBPf17Ufq

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#カガク#生体分子#AI。昨日のAlphaFold3/"AlphaFold 3"初格闘に対して御礼メールが届きました。スペースなしですね。GoogleDeepMind。昨日の成果画像と一緒に。 pic.twitter.com/72oHpN1aa9

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#カガク#生体分子#AI。AlphaFold3/"AlphaFold 3"初試用。AlphaFill構造で3Dプリンタ模型作成済みのPDB 3HCDのA鎖で。AlphaFold 3で得られるcifデータは結合情報がないのでPyMOLでPDBデータに変換。明日はPDB 3HCD構造との重ね合わせにトライ。 AlphaFold Server: alphafoldserver.com/about pic.twitter.com/qVe30T3PBP

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#カガク#生体分子#分子#医薬#新刊。“元素・分子が登場する本を読もう!” 「奇跡の薬16の物語」掲載分子追加開始。3段3頁の索引順に,前途洋々で緒についたばかり。JmolトピックNo.1224 ecosci.jp/chem13/topics2… 分子画像はアンピシリン(ampicillin)。 pic.twitter.com/7y18Qs44wa

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#カガク##生体分子#分子#医薬#感染。新型コロナウイルス(SARS-CoV-2|COVID-19)。新型コロナ5類移行1年。“後遺症/long COVID”関連,最近の情報。 ecosci.jp/COVID-19/#lc pic.twitter.com/XKaTFhUzMY

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#カガク##がん#生体分子#分子。鍵と鍵穴。グラデーション。Nature ハイライト「がん:マイクロサテライト不安定性がんにおけるWRN阻害剤」のPDB 8PFO(他に8PFP・8PFL)とそのPDBsumデータ,阻害剤HRO761が結合したWRN構造。緑優勢。JmolトピックNo.1227 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.twitter.com/KmqJtF4VcJ

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#カガク#生体分子#分子#医薬#AI。話題騒然。スペースが入ったり入らなかったり。"alphafold 3" or alphafold3。 pic.twitter.com/66DyoCs9vu

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#カガク#生体分子#分子。膜タンパク質。LigPlot+による“鍵と鍵穴”。グラデーション。本日公開PDB 8JVIのA鎖とそのPDBsmデータ,アンタゴニストA1が結合したTRPV4。緑・ピンク拮抗。生命創成探究センター「TRPV4イオンチャネル阻害の構造…」。JmolトピックNo.1068に追記。 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.twitter.com/jtOtqR7ClX

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#カガク#生体分子#分子。膜タンパク質。LigPlot+による“鍵と鍵穴”。グラデーション。本日公開のPDBデータ376件の中から8U43のA鎖とそのPDBsmデータ,PIP2-Br4が結合したTRPV1。緑・ピンク拮抗。JmolトピックNo.1068に追記。 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.twitter.com/chCcBl77A0

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#カガク。2018年「世界を変えた書物展」で。 photos.app.goo.gl/FS6nYsckpnoLm3… pic.twitter.com/AbCSM9jIlq

化学と歴史のネタ帳@kagaku_netacho

17世紀にオランダの無名なレーウェンフックが顕微鏡で驚くべき微小な微生物の世界を発見して以来,顕微鏡作成技術が発展し,18世紀には携帯用顕微鏡によってミクロな自然界を観察する娯楽が流行しました.同時期に普及した携帯用地球儀がマクロな自然像を提供したことを考えると示唆深いですね.

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#カガク#ツタエル。7/31でecosci.jpは28歳。この1年もいろいろありました。 ecosci.jp/inet/heya_hist… pic.twitter.com/gZE4N0dgIY

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#カガク#生体分子#分子。鍵と鍵穴。グラデーション。5/1公開PDB 8J81とそのPDBsumデータ,ペプトイド(ペプチド類似構造分子)が結合したMDM2。緑優勢。論文未出,東京大学の研究グループによる。JmolトピックNo.880に追記。 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.twitter.com/YgarKyQS0K

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#カガク#書籍#元素。Si。太っ腹な化学同人さんから無償配布された「化学」4月号(元素手帳もついて)特集はケイ素! 有機概念図でもしっかりSiに対応しています。それ以外の元素についても。 ecosci.jp/sheet/orgs_hel… pic.twitter.com/dBxGAx7GKE

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#カガク#生体分子#分子#医薬。膜タンパク質。鍵と鍵穴。グラデーション。テトラヒドロカンナビバリン(tetrahydrocannabivarin)が結合したTRPV3構造PDB 8V6L(他に8V6M・8V6N・8V6Oあり)のA鎖と同PDBsumデータ。緑優勢。JmolトピックNo.1068に追記。 ecosci.jp/chem13/topics2… pic.twitter.com/ndZTxEuKQ9

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#カガク#生体分子#分子#医薬。膜タンパク質。鍵と鍵穴。グラデーション。ボルチオキセチン(vortioxetine)が結合した5-HT3受容体PDB 8AW2(他に8AXDあり,8BL8・8BLA・8BLBは未公開)とそのPDBsumデータ。5-HT3Rは非GPCR。緑優勢。JmolトピックNo.916に追記。 ecosci.jp/chem13/topics1… pic.twitter.com/HiUAaw6Jh6

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